De hoogte van de jaarlijkse schoolkosten is afhankelijk van het leerjaar en de studierichting. Deze bijdrage bestaat uit drie onderdelen eventueel aangevuld met specifieke kosten.
Het boekenfonds, voor de huur van de schoolboeken en de aanschaf van werkboeken.
Het in bezit hebben van boeken is nodig voor het volgen van onderwijs. Om de kosten te beperken heeft het Commanderij College een boekenfonds ingesteld. De bijdrage voor de kosten van dit boekenfonds is onderwerp van gesprek in de Tweede Kamer. De verwachting is, dat hiervoor vanaf 1 augustus 2008 geen kosten meer voor in rekening worden gebracht.
2. Niet-subsidiabele kosten, zoals sportevenementen, toneel- en filmvoorstellingen, feesten (Sinterklaas, Kerstmis, carnaval), culturele activiteiten, kosten voor begeleiding, introductiedagen en vakkenpakket- en beroepskeuze, kantinekosten, e.d. Hiervoor wordt een bedrag van € 40,-- in rekening gebracht.
3. Bijdrage ouderraad van € 3,50. Dit is een vrijwillige bijdrage ter ondersteuning van het werk van de ouderraad ten behoeve van leerlingen en ouders.
Voor de leerlingen van de vmbo-afdelingen komen daar de kosten van de specifieke kleding, schoeisel, gereedschappen en/of materialen nog bij