Na de basisvorming begint in het vierde leerjaar het tweedefase-onderwijs voor havo, atheneum en gymnasium
In de tweede fase komt de nadruk meer te liggen op zelfstandig studeren. Het lesrooster is daarop aangepast, evenals het lesgebouw. Daarin is onder meer de Mediatheek ingericht, die op het Commanderij College de benaming "Studiehuis" heeft gekregen, waar de leerlingen individueel of in groepen kunnen studeren en gebruik kunnen maken van de aanwezige faciliteiten. Faciliteiten zoals werkplekken met computers, individuele - en groepswerkplekken zonder computer en de uitleen van materialen.
Leerlingen kunnen de aanwezige materialen lenen voor het maken van werkstukken.
Na de basisvorming begint in het vierde leerjaar het tweedefase-onderwijs voor havo, atheneum en gymnasium
In de tweede fase komt de nadruk meer te liggen op zelfstandig studeren. Het lesrooster is daarop aangepast, evenals het lesgebouw. Daarin is onder meer de Mediatheek ingericht, die op het Commanderij College de benaming "Studiehuis" heeft gekregen, waar de leerlingen individueel of in groepen kunnen studeren en gebruik kunnen maken van de aanwezige faciliteiten. Faciliteiten zoals werkplekken met computers, individuele - en groepswerkplekken zonder computer en de uitleen van materialen.
Leerlingen kunnen de aanwezige materialen lenen voor het maken van werkstukken.